有不少的疾病与尖锐湿疣的发病情况相似，常被误认为尖锐湿疣，给患者带来了巨大的痛苦，影响了自己正常的生活。其实，尖锐湿疣的症状诊断主要依据接触传染病史、尖锐湿疣发病部位、临床症状、临床试验及实验室有关检查来确定。对大多数病例，根据尖锐湿疣的发病部位及典型临床特征则不难作出诊断。
首先,要询问患者是否有接触尖锐湿疣的传染病史，要询问患者的性伴侣是否患有尖锐湿疣和有没有其他或是性活动方式，如肛交等。尖锐湿疣患者多有异常或非婚姻性生活史或有与尖锐湿疣患者、hpv感染者性接触或共用毛巾、衣物、盆等物品的病史。
其次是尖锐湿疣的好发部位一般是是男女性外阴部及肛门部位。除这些部位外，一些特殊的部位如口腔、咽喉部等部位的尖锐湿疣病变在特殊人群中应注意。在检查尖锐湿疣发病部位过程中，不要只检查患者所述病变部位，而且要对患者进行较全面的检查，比如说在检查外阴的同时还应检查肛门部位，对有特殊性活动方式的患者还要进行口腔、咽喉等部位的检查。
第三点就是尖锐湿疣的临床特征。在检查的过程当中要仔细观察损害形态、分布、颜色、大小、表面情况等。尖锐湿疣特征性损害是典型的菜花型损害，颜色鲜红、淡红或少数呈污灰色，病变组织脆、擦拭后容易出血。
最后一点就是尖锐湿疣的临床试验。醋酸试验和甲苯胺蓝试验是两种用于尖锐湿疣诊断的临床检查方法。目前临床试验多用醋酸试验，醋酸试验阳性对尖锐湿疣诊断有较为重要的意义。
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